这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fcScan。
Bioconductor版本:3.13
这个包是用来检测基因组坐标下降的组合在一个用户定义的窗口大小以及用户定义确定相邻重叠集群。它可以用于基因组数据的集群都是建立在特定的染色体或特定链。集群可以执行与“贪婪”选项允许这样的存在额外的网站内允许窗口大小。
作者:阿卜杜拉El-Kurdi < ak161在aub.edu.lb > Ghiwa khalil < gk39在aub.edu.lb >乔治Khazen皮埃尔Khoueiry < gkhazen在lau.edu.lb > <在aub.edu.lb pk17 >
维护人员:皮埃尔Khoueiry < pk17在aub.edu.lb >阿卜杜拉El-Kurdi < ak161在aub.edu.lb >
从内部引用(R,回车引用(“fcScan”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fcScan”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“fcScan”)
HTML | R脚本 | fcScan |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,GenomeAnnotation,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | 统计数据,plyr,VariantAnnotation,SummarizedExperiment,rtracklayer,GenomicRanges、方法、IRanges |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | fcScan_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | fcScan_1.6.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | fcScan_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fcScan |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fcScan |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fcScan/ |
包下载报告 | 下载数据 |