此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见fCCAC.
Bioconductor版本:3.13
应用功能典型相关分析评估核酸测序数据集的协方差,如染色质免疫沉淀后深度测序(ChIP-seq)。该包也可以用于其他类型的测序数据,如neMeRIP-seq(见PMID: 29489750)。
作者:Pedro Madrigal <生物信息学。gmail.com>的工程师
维护者:Pedro Madrigal <生物信息学。gmail.com>的工程师
引文(从R内,输入引用(“fCCAC”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("fCCAC")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“fCCAC”)
R脚本 | fCCAC装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 报道,遗传学,测序,软件,转录 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3.0),S4Vectors,IRanges,GenomicRanges、网格 |
进口 | 食品及药物管理局,RColorBrewer,genomation,ggplot2,ComplexHeatmap, grDevices, stats, utils |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | fCCAC_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | fCCAC_1.18.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | fCCAC_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCCAC |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fCCAC |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fCCAC/ |
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