drawProteins

DOI:10.18129 / B9.bioc.drawProteins

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见drawProteins．

从Uniprot API输出中绘制蛋白质示意图的包

Bioconductor版本:3.13

这个包从Uniprot API输出中绘制蛋白质原理图。从GET命令返回的JSON中，它从Uniprot Features API创建了一个数据帧。然后，基于ggplot2和碱基R的geoms可以使用这个数据帧来绘制蛋白质示意图。

作者:保罗·布伦南[aut, cre]

维护者:Paul Brennan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("drawProteins")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“drawProteins”)

超文本标记语言	R脚本	使用drawProteins
超文本标记语言	R脚本	在drawProteins中使用extract_transcripts
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	FunctionalPrediction，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(3.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)
进口	ggplot2，httr，dplyr，readr，tidyr
链接
建议	covr，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins
BugReports	https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins/issues/new
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	drawProteins_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	drawProteins_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	drawProteins_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawProteins
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/drawProteins
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/drawProteins/
软件包下载报告	下载数据