这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅doppelgangR。
Bioconductor版本:3.13
主要功能是doppelgangR(),它需要作为最小输入ExpressionSet对象的列表,列表和搜索所有对复制样品。搜索是基于基因组数据(exprs (eset)),表现型/临床数据(pData (eset)),和“吸烟枪”——据说pData中发现的惟一标识符(eset)。
作者:利沃尔德伦(aut (cre),马库斯拒绝前进(aut,施莱),马塞尔•拉莫斯(施)
维护人员:利未Waldron < lwaldron。研究在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“doppelgangR”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“doppelgangR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“doppelgangR”)
HTML | R脚本 | doppelgangR装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,质量控制,RNASeq,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(5.5年) |
许可证 | GPL (> = 2.0) |
取决于 | R (> = 3.5.0),Biobase,BiocParallel |
进口 | 股东价值分析,嫁祸于,消化,mnormt、方法、grDevices图形,统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,curatedOvarianData,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lwaldron/doppelgangR |
BugReports | https://github.com/lwaldron/doppelgangR/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | doppelgangR_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | doppelgangR_1.20.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | doppelgangR_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/doppelgangR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ doppelgangR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/doppelgangR/ |
包下载报告 | 下载数据 |