命运
DOI:10.18129 / B9.bioc.destiny
这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅命运。
创建扩散地图
Bioconductor版本:3.13
创建和情节扩散地图。
作者:菲利普•安格勒(cre, aut)
,Laleh Haghverdi[所有],麻仁Buttner(施)书,费边(施),卡斯滕•马尔(施)Florian Buttner[所有]
维护人员:菲利普•安格勒<菲利普。安格勒在helmholtz-muenchen.de >
从内部引用(R,回车引用(“命运”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“命运”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,聚类,软件,可视化 |
| 版本 | 3.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(6年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.4.0) |
| 进口 | 方法、图形、grDevices跑龙套,统计数据,矩阵,Rcpp(> = 0.10.3),RcppEigen,RSpectra(0.14 > = 0),irlba,pcaMethods,Biobase,BiocGenerics,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,ggplot2,ggplot.multistats,tidyr,tidyselect,ggthemes,VIM,knn.covertree,代理,RcppHNSW,平滑,尺度,scatterplot3d |
| 链接 | Rcpp,RcppEigen,grDevices |
| 建议 | nbconvertR(> = 1.3.2),igraph,testthat,模糊神经网络,tidyr |
| SystemRequirements | c++ 11日jupyter nbconvert(见nbconvertR的安装文件) |
| 增强了 | rgl,SingleCellExperiment |
| URL | https://theislab.github.io/destiny/https://github.com/theislab/destiny/https://www.helmholtz-muenchen.de/icb/destiny//www.anjoumacpherson.com/packages/destinyhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv715 |
| BugReports | https://github.com/theislab/destiny/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ctgGEM,CytoTree,phemd |
| 建议我 | CelliD,CellTrails,单片眼镜,嘘 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | destiny_3.6.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/destiny |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/命运 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/destiny/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
