derfinderPlot

DOI:10.18129 / B9.bioc.derfinderPlot

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅derfinderPlot

绘图函数derfinder

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了绘图函数结果derfinder包。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre)安德鲁·e·贾菲(aut)黑色,杰弗里·t .韭菜(aut)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“derfinderPlot”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“derfinderPlot”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“derfinderPlot”)

HTML R脚本 介绍derfinderPlot
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,可视化
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(7年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.2)
进口 derfinder(> = 1.1.0),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2、图形、grDevicesIRanges(> = 1.99.28),limma、方法、plyr,RColorBrewer,reshape2,S4Vectors(> = 0.9.38),尺度,跑龙套
链接
建议 biovizBase(> = 1.27.2),bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),sessioninfo,knitr(> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),org.Hs.eg.db,RefManageR,rmarkdown(> = 0.3.3),testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,covr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/leekgroup/derfinderPlot
BugReports https://support.bioconductor.org/t/derfinderPlot
取决于我
进口我 brainflowprobes,recountWorkflow
建议我 derfinder,GenomicState,regionReport
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 derfinderPlot_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 derfinderPlot_1.26.0.zip
macOS 10.13(高山脉) derfinderPlot_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ derfinderPlot
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderPlot/
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