crisprseekplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.crisprseekplus

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅crisprseekplus。

crisprseekplus

Bioconductor版本:3.13

生物信息学平台包含接口与offTargetAnalysis和compare2Sequences CRISPRseek包,和GUIDEseqAnalysis。

作者:苏菲Wigmore <苏菲。Wigmore umassmed.edu >,高山Kucukural <高山。在umassmed.edu kucukural >,Lihua Julie Zhu , Michael Brodsky , Manuel Garber

维护人员:高山Kucukural <高山。在umassmed.edu kucukural >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“crisprseekplus”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“crisprseekplus”)

HTML	R脚本	DEBrowser装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneRegulation,SequenceMatching,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(5年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.3.0),闪亮的,shinyjs,CRISPRseek
进口	DT跑龙套,GUIDEseq,GenomicRanges,GenomicFeatures,BiocManager,BSgenome,AnnotationDbi,哈希
链接
建议	testthat,rmarkdown,knitr,R.rsp
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus
BugReports	https://github.com/UMMS-Biocore/crisprseekplus/issues/new
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	crisprseekplus_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	crisprseekplus_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	crisprseekplus_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprseekplus
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ crisprseekplus
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/crisprseekplus/
包下载报告	下载数据