contiBAIT

DOI:10.18129 / B9.bioc.contiBAIT

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅contiBAIT

提高早期使用Strand-Seq数据构建基因组装配

Bioconductor版本:3.13

使用链继承数据从多个单个细胞的生物基因组组装,contiBAIT一起尚留有未架起桥梁集群重叠群成公认的染色体,和秩序的重叠群在这些染色体。

作者:基兰奥尼尔,马克山,迈克戈特利布

维护人员:基兰奥尼尔< koneill在bccrc.ca >

从内部引用(R,回车引用(“contiBAIT”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“contiBAIT”)

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文档

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PDF R脚本 flowBi
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews CellBasedAssays,遗传学,GenomeAssembly,ImmunoOncology,质量控制,软件,WholeGenome
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(5.5年)
许可证 BSD_2_clause +文件许可证
取决于 黑洞(> = 1.51.0-3),Rsamtools(> = 1.21)
进口 data.tablegrDevices,线索,集群,gplots,BiocGenerics(> = 0.31.6),S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,Rcpp,茶匙,GenomicFiles,gtools,rtracklayer,BiocParallel,DNAcopy,色彩,reshape2,ggplot2、方法、exomeCopy,GenomicAlignments,
链接 Rcpp,黑洞
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
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构建报告

包档案

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源包 contiBAIT_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 contiBAIT_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉) contiBAIT_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/contiBAIT
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ contiBAIT
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/contiBAIT/
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