这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅compEpiTools。
Bioconductor版本:3.13
分析计算表观基因组学工具开发,集成和同步可视化的各种跨多个基因组(epi)基因组学数据类型地区多个样本。
作者:马狄亚(aut),卡基肖尔(aut (cre)
维护人员:Kamal基肖尔<卡马尔。在gmail.com fartiyal84 >
从内部引用(R,回车引用(“compEpiTools”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“compEpiTools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“compEpiTools”)
R脚本 | compEpiTools.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 报道,GeneExpression,GenomeAnnotation,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(7年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R(> = 3.1.1)、方法topGO,GenomicRanges |
进口 | AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,Rsamtools、平行、grDevicesgplots,IRanges,GenomicFeatures,XVector,methylPipe,GO.db,S4Vectors,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,org.Mm.eg.db,knitr,rtracklayer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | compEpiTools_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | compEpiTools_1.26.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | compEpiTools_1.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compEpiTools |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ compEpiTools |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/compEpiTools/ |
包下载报告 | 下载数据 |