clusterSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.clusterSeq

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅clusterSeq。

高通量测序数据的聚类识别co-expression模式

Bioconductor版本:3.13

识别基于他们的集群中的基因表达在多个生物样品(复制)。

作者:托马斯·Hardcastle &艾琳Papatheodorou

维护人员:托马斯·Hardcastle < tjh48在cam.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“clusterSeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“clusterSeq”)

PDF	R脚本	先进baySeq分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,测序,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 3.0.0)、方法BiocParallel,baySeq、图形数据,跑龙套
进口	BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	clusterSeq_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	clusterSeq_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	clusterSeq_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterSeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ clusterSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clusterSeq/
包下载报告	下载数据