这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅circRNAprofiler。
Bioconductor版本:3.13
R-based计算circRNAs的全面计算机分析的框架。该计算框架允许合并和分析circRNAs之前检测到多个公开的基于注解的circRNA检测工具。它涵盖了circRNAs分析从微分表达式分析的不同方面,进化的保护,生物起源功能分析。
作者:西蒙娜Aufiero
维护人员:西蒙娜Aufiero <极点。在gmail.com aufiero >
从内部引用(R,回车引用(“circRNAprofiler”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“circRNAprofiler”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“circRNAprofiler”)
HTML | R脚本 | circRNAprofiler |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,DifferentialExpression,FunctionalPrediction,GenePrediction,GenomeAssembly,软件,StructuralPrediction |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.1.0) |
进口 | dplyr,magrittr,readr,rtracklayer,stringr,stringi,DESeq2,刨边机,GenomicRanges,IRanges,seqinr,R.utils,reshape2,ggplot2跑龙套,rlang,S4Vectors统计数据,GenomeInfoDb,universalmotif,AnnotationHub,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,Biostrings,gwascat,BSgenome |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,roxygen2,rmarkdown,devtools,gridExtra,ggpubr,维恩图,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,BiocManager |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Aufiero/circRNAprofiler |
BugReports | https://github.com/Aufiero/circRNAprofiler/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | circRNAprofiler_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | circRNAprofiler_1.6.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | circRNAprofiler_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/circRNAprofiler |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ circRNAprofiler |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/circRNAprofiler/ |
包下载报告 | 下载数据 |