censcyt

DOI:10.18129 / B9.bioc.censcyt

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅censcyt

对审查协变量的微分丰度分析高维血细胞计数

Bioconductor版本:3.13

高维微分方法丰富分析血细胞计数数据当协变量服从正确的审查(如存活时间)基于多个归责和广义线性混合模型。

作者:里特•格柏(aut (cre)

维护人员:里特•嘉宝< gerberreto在pm.me >

从内部引用(R,回车引用(“censcyt”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“censcyt”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“censcyt”)

HTML R脚本 审查协变量
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews CellBasedAssays,CellBiology,聚类,FeatureExtraction,FlowCytometry,ImmunoOncology,蛋白质组学,SingleCell,软件,生存
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 4.0),diffcyt
进口 BiocParallel,broom.mixed,dirmult,dplyr,刨边机,fitdistrplus,lme4,magrittr,质量、方法、老鼠,multcomp,purrr,rlang,S4Vectors统计数据,stringr,SummarizedExperiment,生存,宠物猫,tidyr,跑龙套
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/retogerber/censcyt
BugReports https://github.com/retogerber/censcyt/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 censcyt_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 censcyt_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉) censcyt_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/censcyt
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ censcyt
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/censcyt/
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