cellbaseR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellbaseR

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见cellbaseR．

从高性能的Cellbase web中查询注释数据

Bioconductor版本:3.13

这个R包使用了为Cellabase数据库实现的详尽的rest式Web服务API。它使研究人员能够从一个数据库中查询和获取丰富的生物信息，节省了大量的时间。另一个好处是，研究人员可以很容易地对不同的生物学主题进行查询，并将所有信息链接在一起，因为所有信息都是集成的。

作者:Mohammed OE Abdallah

维护者:Mohammed OE Abdallah

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("cellbaseR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cellbaseR”)

超文本标记语言	R脚本	简化R中的基因组注释
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，软件，VariantAnnotation
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(4.5年)
许可证	Apache许可证(== 2.0)
取决于	R (>= 3.4)
进口	方法,jsonlite，httr，data.table，pbapply，tidyr，R.utils，Rsamtools，BiocParallel，foreach， utils，并行，doParallel
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，Gviz，VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/melsiddieg/cellbaseR
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cellbaseR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	cellbaseR_1.16.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	cellbaseR_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellbaseR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cellbaseR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellbaseR/
软件包下载报告	下载数据