blima

DOI:10.18129 / B9.bioc.blima

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅blima

预处理和分析工具的Illumina公司微阵列探测器(珠)水平

Bioconductor版本:3.13

包blima包括几个Illumina公司微阵列数据的预处理算法。它集中到珠级别分析和提供新方法的分位数正常化不同长度的向量。它提供了各种各样的背景校正方法包括背景减法,RMA卷积和背景异常值删除。它还实现了方差稳定珠级别的转换。也有实现的方法进行数据汇总。它还提供了对探测器进行t方法(珠)水平和微分表达式的探测水平测试。

作者:Vojtěch Kulvait

维护人员:Vojtěch Kulvait < Kulvait gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“blima”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“blima”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“blima”)

PDF R脚本 blima.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression,GeneExpression,GeneRegulation,微阵列,归一化,预处理,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(7年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.3)
进口 beadarray(> = 2.0.0),Biobase(> = 2.0.0),Rcpp(> = 0.12.8),BiocGenericsgrDevices统计数据,图形
链接 Rcpp
建议 xtable,blimaTestingData,BiocStyle,illuminaHumanv4.db,光民,knitr
SystemRequirements
增强了
URL https://bitbucket.org/kulvait/blima
取决于我
进口我
建议我 blimaTestingData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 blima_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 blima_1.26.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) blima_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blima
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ blima
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/blima/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网