baySeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.baySeq

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅baySeq。

经验贝叶斯分析的微分表达式模式计数数据

Bioconductor版本:3.13

这个包确定微分表达式在高通量计算的数据,比如来自下一代测序机器,计算后验估计可能的微分表达式(或更复杂的假设)通过经验贝叶斯方法。

作者:Thomas j . Hardcastle

维护人员:托马斯·Hardcastle < tjh48在cam.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“baySeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“baySeq”)

PDF	R脚本	先进baySeq分析
PDF	R脚本	baySeq
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,MultipleComparison,圣人,测序,软件
版本	2.26.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(12年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = tripwire)、方法GenomicRanges,abind、并行
进口	刨边机
链接
建议	BiocStyle,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	clusterSeq,埃达,Rcade,segmentSeq,移行细胞癌
进口我	埃达,metaseqR2,riboSeqR,srnadiff
建议我	compcodeR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	baySeq_2.26.0.tar.gz
Windows二进制	baySeq_2.26.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	baySeq_2.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/baySeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ baySeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/baySeq/
包下载报告	下载数据