bayNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.bayNorm

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅bayNorm。

单细胞RNA序列数据规范化

Bioconductor版本:3.13

bayNorm用于单细胞正常化RNA-seq数据。

作者:朱文昊唐(aut (cre),弗兰< U + 00 e7 > ois Bertaux (aut),菲利普·托马斯(aut),克莱尔Stefanelli (aut),马里卡圣(aut),撒母耳Marguerat (aut),瓦希德Shahrezaei (aut)

维护人员:朱文昊唐< wt215在ic.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bayNorm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“bayNorm”)

HTML	R脚本	介绍bayNorm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,归一化,RNASeq,测序,SingleCell,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5)
进口	Rcpp(> = 0.12.12),BB,foreach,迭代器,doSNOW,矩阵平行,质量,locfit,fitdistrplus、数据、方法、图形、grDevicesSingleCellExperiment,SummarizedExperiment,BiocParallel,跑龙套
链接	Rcpp,RcppArmadillo,RcppProgress
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,devtools,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/WT215/bayNorm
BugReports	https://github.com/WT215/bayNorm/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bayNorm_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	bayNorm_1.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	bayNorm_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bayNorm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bayNorm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bayNorm/
包下载报告	下载数据