atSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.atSNP

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见atSNP

亲和性试验用于识别调节snp

Bioconductor版本:3.13

atSNP进行基序匹配与SNP或参考基因组的亲和测试,以及SNP导致的基序匹配变化。

作者:Chandler Zuo [aut], Sunyoung Shin [aut, cre], Sunduz Keles [aut]

维护者:Sunyoung Shin < Sunyoung。Shin在utdallas.edu>

引文(从R内,输入引用(“atSNP”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("atSNP")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“atSNP”)

超文本标记语言 R脚本 atsnp-vignette.html
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeqGenomeAnnotationMotifAnnotation软件可视化
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.6)
进口 BSgenomeBiocFileCacheBiocParallelRcppdata.tableggplot2, grDevices,图形,网格,motifStackrappdirs统计数据,testthat跑龙套,生命周期
链接 Rcpp
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/sunyoungshin/atSNP
BugReports https://github.com/sunyoungshin/atSNP/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 atSNP_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 atSNP_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) atSNP_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/atSNP
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/atSNP
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/atSNP/
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