XINA

DOI:10.18129 / B9.bioc.XINA

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅XINA。

为网络分析的多放映场影剧院等压质量Tagged-based动力学数据

Bioconductor版本:3.13

XINA的目的是,以确定哪些蛋白质中表现出相似的模式,在实验条件下,由于蛋白质与co-abundance模式可能有共同的分子功能。XINA进口多个数据集,网上标签数据集,结合后续子群的数据到多个集群。结果是一个输出描述变化在所有条件。XINA,不仅提取coabundance概要文件内和在实验中,还包含了数据库和蛋白质间交互作用等综合资源KEGG来推断扶少团团员和分子功能,分别产生直观的图形输出。

作者:朗Ho李< lhlee bwh.harvard.edu >和萨沙a·辛格< sasingh bwh.harvard.edu >

维护者:朗Ho李< lhlee bwh.harvard.edu >和萨沙a·辛格< sasingh bwh.harvard.edu >

安装

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“XINA”)

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文档

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HTML	R脚本	xina_user_code
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文本		新闻

细节

biocViews	网络,蛋白质组学,RNASeq,软件,SystemsBiology
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5)
进口	mclust,plyr,冲积,ggplot2,igraph,gridExtra、工具、grDevices图形,跑龙套,STRINGdb
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	XINA_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	XINA_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	XINA_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XINA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ XINA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XINA/
包下载报告	下载数据