VplotR

DOI:10.18129 / B9.bioc.VplotR

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅VplotR

套工具V-plots和计算足迹档案

Bioconductor版本:3.13

从DNA核酸酶消化和保护的模式如DNAse我,微球菌的核酸酶,和Tn5转座酶可以用来推断的位置相关的蛋白质。这个包包含有用paired-end测序片段密度函数分析模式。VplotR促进代V-plots和足迹档案在单一或聚合感兴趣的基因位点。

作者:雅克Serizay (aut (cre)

维护人员:雅克Serizay < jacquesserizay gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“VplotR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“VplotR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“VplotR”)

HTML R脚本 VplotR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ATACSeq,对齐,BiologicalQuestion,报道,NucleosomePositioning,测序,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.0),GenomicRanges,IRanges,ggplot2
进口 cowplot,magrittr,GenomeInfoDb,GenomicAlignments,RColorBrewer,动物园,Rsamtools,S4Vectors平行,reshape2、方法、图形、统计数据
链接
建议 GenomicFeatures,TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer3.sgdGene,testthat,covr,knitr,rmarkdown,pkgdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/js2264/VplotR
BugReports https://github.com/js2264/VplotR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 VplotR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 VplotR_1.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) VplotR_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VplotR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ VplotR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/VplotR/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网