ToxicoGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.ToxicoGx

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见ToxicoGx．

大规模毒理学基因组数据分析

Bioconductor版本:3.13

包含一组执行大规模毒理学基因组数据分析的功能，提供标准化的数据结构来保存与毒理学基因组数据注释、可视化和统计分析相关的信息。

作者:Sisira Nair [aut]， Esther Yoo [aut]， Christopher Eeles [aut]， Amy Tang [aut]， Nehme El-Hachem [aut]， Petr Smirnov [aut]， Benjamin Haibe-Kains [aut, cre]

维护者:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。Kains at utoronto.ca>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ToxicoGx")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ToxicoGx”)

超文本标记语言	R脚本	毒理基因组学综合数据分析的R平台
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，遗传药理学，药物基因组学，软件
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)，CoreGx
进口	SummarizedExperiment，S4Vectors，Biobase，BiocParallel，ggplot2，宠物猫，dplyr，caTools，下载器，magrittr、方法、reshape2，tidyr，data.table，为了，尺度，图形，grDevices，并行，统计，utils，limma，jsonlite
链接
建议	rmarkdown，testthat，BiocStyle，knitr，tinytex，devtools，PharmacoGx，xtable，减价
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ToxicoGx_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	ToxicoGx_1.2.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ToxicoGx_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ToxicoGx
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ToxicoGx
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ToxicoGx/
软件包下载报告	下载数据