TimeSeriesExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.TimeSeriesExperiment

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TimeSeriesExperiment。

分析短时间序列数据

Bioconductor版本:3.13

TimeSeriesExperiment是短时间的可视化和分析工具箱课程数据。军售计划包括降维,集群,两个示例微分表达式测试和基因排序技术。此外,它还提供了获取丰富路径的方法。

作者:局域网阮:“学校没有教导(cre, aut)

维修工:局域网阮:“学校没有教导< nlhuong90 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TimeSeriesExperiment”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TimeSeriesExperiment”)

HTML	R脚本	基因表达时间进程数据分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,微生物组,归一化,通路,PrincipalComponent,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录,可视化
版本	1.10.1
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1),S4Vectors(> = 0.19.23),SummarizedExperiment(> = 1.11.6)
进口	dynamicTreeCut,dplyr,刨边机,DESeq2,ggplot2(> = 3.0.0)、图形Hmisc,limma、方法、magrittr,代理统计数据,宠物猫,tidyr,素食主义者,冬青,跑龙套
链接
建议	Biobase,BiocFileCache(> = 1.5.8),circlize,ComplexHeatmap,GO.db、grDevices、网格knitr,org.Mm.eg.db,org.Hs.eg.db,质量,RColorBrewer,rmarkdown,UpSetR
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/nlhuong/TimeSeriesExperiment
BugReports	https://github.com/nlhuong/TimeSeriesExperiment/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TimeSeriesExperiment_1.10.1.tar.gz
Windows二进制	TimeSeriesExperiment_1.10.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	TimeSeriesExperiment_1.10.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TimeSeriesExperiment
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TimeSeriesExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TimeSeriesExperiment/
包下载报告	下载数据