TNBC.CMS

DOI:10.18129 / B9.bioc.TNBC.CMS

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TNBC.CMS。

TNBC.CMS: Prediction of TNBC Consensus Molecular Subtypes

Bioconductor版本:3.13

这个方案实现了一个基于机器学习分类器分配的共识分子亚型TNBC样本。它还提供了功能总结基因组和临床特点。

作者:Doyeong Yu,金,她在公园,Charny公园

维护人员:Doyeong Yu < parklab。bi: gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TNBC.CMS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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PDF	R脚本	TNBC.CMS.pdf
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文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,GeneExpression,GenePrediction,软件,SupportVectorMachine
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0),e1071,quadprog,SummarizedExperiment
进口	GSVA(> = 1.26.0),pheatmapgrDevices,RColorBrewer,pracma,GGally,R.utils,forestplot,ggplot2,ggpubr,生存、网格、数据、方法
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TNBC.CMS_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	TNBC.CMS_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	TNBC.CMS_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TNBC.CMS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TNBC.CMS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TNBC.CMS/
包下载报告	下载数据