此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见TCseq.
Bioconductor版本:3.13
表观基因组和转录组时间序列数据的定量和差异分析,时间序列数据的时间模式的聚类分析和可视化。
作者:Mengjun Wu
维护者:Mengjun Wu
引文(从R内,输入引用(“TCseq”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TCseq")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TCseq”)
R脚本 | TCseq装饰图案 | |
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,聚类,DifferentialExpression,表观遗传学,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | 刨边机,BiocGenerics,reshape2,GenomicRanges,IRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments,Rsamtools,e1071,集群,ggplot2,网格,grDevices,统计,utils,方法,locfit |
链接 | |
建议 | testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TCseq_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | TCseq_1.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | TCseq_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCseq |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TCseq |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TCseq/ |
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