SynExtend

DOI:10.18129 / B9.bioc.SynExtend

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见SynExtend．

使用Synteny对象的工具

Bioconductor版本:3.13

基因组序列之间的共享顺序提供了大量信息。R包DECIPHER生成的Synteny对象提供了关于共享顺序的定量信息。SynExtend提供了从Synteny对象中提取信息的工具。

作者:Nicholas Cooley [aut, cre]，阿德尔·费尔南多[ctb]，埃里克·赖特[aut]

维护者:Nicholas Cooley

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SynExtend")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SynExtend”)

PDF	R脚本	UsingSynExtend
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，ComparativeGenomics，DataImport，遗传学，软件
版本	1.4.1
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0.0)，解读(> = 2.18.0)
进口	方法,Biostrings，S4Vectors，IRanges， utils，统计
链接
建议	BiocStyle，knitr，减价，rtracklayer，igraph，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SynExtend_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	SynExtend_1.4.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SynExtend_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SynExtend
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SynExtend/
软件包下载报告	下载数据