SubCellBarCode

DOI:10.18129 / B9.bioc.SubCellBarCode

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见SubCellBarCode．

SubCellBarCode:用于稳健映射和可视化整个人类空间蛋白质组的集成工作流

Bioconductor版本:3.13

基于质谱的空间蛋白质组学能够在蛋白质组范围内绘制蛋白质亚细胞定位(Orre等人，2019，分子细胞)。SubCellBarCode R包将蛋白质稳健地分类到相应的亚细胞定位。

作者:Taner Arslan

维护者:Taner Arslan < Taner。阿尔斯兰在基斯>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SubCellBarCode")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SubCellBarCode”)

超文本标记语言	R脚本	SubCellBarCode R Markdown小插图
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6)
进口	Rtsne，scatterplot3d，脱字符号，e1071，ggplot2，gridExtra，networkD3，ggrepel，图形，统计，org.Hs.eg.db，AnnotationDbi
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SubCellBarCode_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	SubCellBarCode_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	SubCellBarCode_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SubCellBarCode
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SubCellBarCode
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SubCellBarCode/
软件包下载报告	下载数据