SubCellBarCode

DOI:10.18129 / B9.bioc.SubCellBarCode

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见SubCellBarCode

SubCellBarCode:用于稳健映射和可视化整个人类空间蛋白质组的集成工作流

Bioconductor版本:3.13

基于质谱的空间蛋白质组学能够在蛋白质组范围内绘制蛋白质亚细胞定位(Orre等人,2019,分子细胞)。SubCellBarCode R包将蛋白质稳健地分类到相应的亚细胞定位。

作者:Taner Arslan

维护者:Taner Arslan < Taner。阿尔斯兰在基斯>

引文(从R内,输入引用(“SubCellBarCode”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SubCellBarCode")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SubCellBarCode”)

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文本 新闻

细节

biocViews 分类MassSpectrometry蛋白质组学软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.6)
进口 Rtsnescatterplot3d脱字符号e1071ggplot2gridExtranetworkD3ggrepel,图形,统计,org.Hs.eg.dbAnnotationDbi
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SubCellBarCode_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 SubCellBarCode_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) SubCellBarCode_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SubCellBarCode
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SubCellBarCode
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SubCellBarCode/
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