光谱
DOI:10.18129 / B9.bioc.Spectra
此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见光谱。
质谱数据的光谱基础结构
Bioconductor版本:3.13
光谱包定义了一个高效的基础设施，用于存储和处理质谱和功能，以子集，处理，可视化和比较光谱数据。它提供了不同的实现(后端)来存储质谱数据。它们包括用于快速数据访问和处理的后端，以及用于非常大的数据集的后端，以确保较小的内存占用。
作者:rformassspectra Package Maintainer [cre]， Laurent Gatto [aut]
，约翰·雷纳[au]，塞巴斯蒂安·吉布[au]
维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者
引文(从R内，输入引用(“光谱”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Spectra")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“光谱”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 光谱对象的描述和使用 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，蛋白质组学，软件 |
| 版本 | 1.2.2 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 4.0.0)，S4Vectors，BiocParallel，ProtGenerics(> = 1.23.8) |
| 进口 | 方法,IRanges，MsCoreUtils(>= 1.3.3)，图形，grDevices，统计，工具，utils，fs，BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr(> = 1.1.0版),msdata(> = 0.19.3),roxygen2，BiocStyle(> = 2.5.19),mzR(> = 2.19.6),rhdf5(> = 2.32.0),rmarkdown，vdiffr，magrittr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/Spectra |
| BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/Spectra/issues |
| 全靠我 | MsBackendMassbank，MsBackendMgf |
| 进口我 | |
| 建议我 | xcms |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Spectra_1.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | Spectra_1.2.2.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | Spectra_1.2.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Spectra |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Spectra |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Spectra/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
