此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见SRGnet.
Bioconductor版本:3.13
我们开发了SRGnet来分析转录组谱中的协同调节机制,这些机制可以增强细胞对突变、药物或环境暴露组合的整体反应。该软件包可用于识别协同反应基因下游的调控模块,优先考虑可能是潜在干预目标的协同调控基因,并将基因扰动实验置于背景下。
作者:Isar Nassiri [aut, cre], Matthew McCall [aut, cre]
维护者:Isar Nassiri
引文(从R内,输入引用(“SRGnet”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | 回归,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.17.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.3.1),EBcoexpress,质量,igraph,pvclust(2.0 > = 0),“绿带运动”(> = 2.1.1),limma, DMwR (>= 0.4.1),matrixStats,Hmisc |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | SRGnet_1.17.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | SRGnet_1.17.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SRGnet |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SRGnet |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SRGnet/ |
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