RpsiXML

DOI:10.18129 / B9.bioc.RpsiXML

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RpsiXML。

PSI-MI 2.5 R接口文件

Bioconductor版本:3.13

查询,数据结构和接口交互的可视化数据集。这个包inplements PSI-MI 2.5标准和支持到现在8数据库。进一步的数据库支持PSI-MI 2.5标准将不断增加。

作者:Jitao大卫·张(cre aut,施莱)Stefan Wiemann[所有],马克·卡尔森(施),托尼蒋介石(施)

维修工:Jitao大卫张< jitao_david。张在roche.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RpsiXML”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RpsiXML”)

PDF	R脚本	RpsiXML方案的应用实例
PDF	R脚本	阅读PSI-25 XML文件
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,蛋白质组学,软件
版本	2.34.0
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(13岁)
许可证	LGPL-3
取决于	方法,XML(> =测试盒框),跑龙套
进口	注释(> = 1.21.0),图(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
链接
建议	org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,Rgraphviz,ppiStats,ScISI,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com
取决于我	ScISI
进口我	ScISI
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RpsiXML_2.34.0.tar.gz
Windows二进制	RpsiXML_2.34.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	RpsiXML_2.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RpsiXML
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RpsiXML
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RpsiXML/
包下载报告	下载数据