RcwlPipelines

DOI:10.18129 / B9.bioc.RcwlPipelines

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RcwlPipelines。

基于Rcwl生物信息学管道

Bioconductor版本:3.13

的生物信息学工具和管道基于R和通用工作流语言。

作者:羌胡(aut (cre),钱氏(aut),双高(aut)

维修工:羌胡<羌族。胡在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RcwlPipelines”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RcwlPipelines”)

HTML	R脚本	RcwlPipelines
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,DNASeq,DataImport,ImmunoOncology,预处理,质量控制,RNASeq,软件,WorkflowStep
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6),Rcwl,BiocFileCache
进口	rappdirs、方法、跑龙套git2r,httr,S4Vectors
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements	nodejs
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RcwlPipelines_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	RcwlPipelines_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcwlPipelines
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RcwlPipelines
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RcwlPipelines/
包下载报告	下载数据