Rbowtie

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rbowtie

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Rbowtie。

R领结包装

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了一个R包装流行的领结短读准仪SpliceMap附近,一个新创拼接结发现和定位工具。使用的包是QuasR bioconductor包。我们建议使用而不是直接使用Rbowtie QuasR包。

作者:安妮塔我们,迈克尔·哈恩(Florian Hahne) B持枪证

维护人员:迈克尔Stadler <迈克尔。施在fmi.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Rbowtie”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Rbowtie”)

HTML	R脚本	介绍Rbowtie
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	对齐,测序,软件
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0 |文件许可证
取决于
进口
链接
建议	testthat平行,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	https://github.com/fmicompbio/Rbowtie
BugReports	https://github.com/fmicompbio/Rbowtie/issues
取决于我	QuasR
进口我	MACPET,multicrispr
建议我	eisaR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Rbowtie_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	Rbowtie_1.32.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Rbowtie_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbowtie
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rbowtie
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rbowtie/
包下载报告	下载数据