RNAmodR。RiboMethSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR.RiboMethSeq

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAmodR。RiboMethSeq

RiboMethSeq检测2'-O甲基化

Bioconductor版本:3.13

RNAmodR。RiboMethSeq implements the detection of 2'-O methylations on RNA from experimental data generated with the RiboMethSeq protocol. The package builds on the core functionality of the RNAmodR package to detect specific patterns of the modifications in high throughput sequencing data.

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre],丹尼斯·拉方丹[ctb, nd]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

引文(从R内,输入引用(“RNAmodR.RiboMethSeq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAmodR.RiboMethSeq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAmodR.RiboMethSeq”)

超文本标记语言 R脚本 RNAmodR。RiboMethSeq
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 测序软件可视化WorkflowStep
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),RNAmodR(> = 1.5.3)更正
进口 方法,S4VectorsBiocGenericsIRangesGenomicRangesGviz
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatrtracklayerRNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq
BugReports https://github.com/FelixErnst/RNAmodR.RiboMethSeq/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RNAmodR.RiboMethSeq_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 RNAmodR.RiboMethSeq_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) RNAmodR.RiboMethSeq_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR.RiboMethSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAmodR.RiboMethSeq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAmodR.RiboMethSeq/
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