这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅R3CPET。
Bioconductor版本:3.13
包提供了一组方法来推断的蛋白质更可能共同维护chormatin交互ChIA-PET实验结果。
作者:杨Djekidel MN, Chen等人。
维护人员:穆罕默德Nadhir Djekidel < djek。nad gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“R3CPET”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“R3CPET”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“R3CPET”)
R脚本 | 3 cpet:找到辅助因子复合物保持Chia-PET交互 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 贝叶斯,GeneExpression,GenePrediction,GraphAndNetwork,嗝,网络,NetworkInference,软件 |
版本 | 1.24.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(6.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.2),Rcpp(> = 0.10.4)方法 |
进口 | 方法、并行ggplot2,pheatmap,clValid,igraph,data.table,reshape2,Hmisc,RCurl,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges(> = 2.13.12),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.31.8),ggbio |
链接 | Rcpp |
建议 | BiocStyle,knitr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,biovizBase,biomaRt,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,闪亮的,ChIPpeakAnno |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/sirusb/R3CPET/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | R3CPET_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | R3CPET_1.24.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | R3CPET_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R3CPET |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ R3CPET |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/R3CPET/ |
包下载报告 | 下载数据 |