此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见王子.
Bioconductor版本:3.13
PrInCE(从共洗脱中预测相互作用组)使用在数据集衍生特征上训练的朴素贝叶斯分类器,从共洗脱色谱图谱中恢复蛋白质-蛋白质相互作用。这个包包含PrInCE的R实现。
作者:Michael skinner [aut, trl, cre], R. Greg Stacey [ctb], Nichollas Scott [ctb], Anders Kristensen [ctb], Leonard Foster [aut, leading]
维护者:Michael Skinnider < Michael。在msl.ubc.ca>
引文(从R内,输入引用(“王子”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PrInCE")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“王子”)
超文本标记语言 | R脚本 | PrInCE共洗脱数据的相互作用组重建 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | NetworkInference,蛋白质组学,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.6.0) |
进口 | purrr(> = 0.2.4),dplyr(> = 0.7.4),tidyr(> = 0.8.99),预测(> = 8.2),进步(> = 1.1.2),Hmisc(> = 4.0),naivebayes(> = 0.9.1),robustbase(> = 0.92 7),管理员(> = 0.8.0),LiblineaR(> = 2.10 8),speedglm(> = 0.3 2),测试人员(> = 0.1.7),magrittr(> = 1.5),Biobase(> = 2.40.0),MSnbase(>= 2.8.3),统计,utils,方法,Rdpack(> = 0.7) |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/fosterlab/PrInCE/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | PrInCE_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | PrInCE_1.8.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | PrInCE_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PrInCE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PrInCE |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PrInCE/ |
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