π
DOI:10.18129 / B9.bioc.Pi
这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅π。
利用遗传学证据优先考虑药物靶点的基因和通路水平
Bioconductor版本:3.13
优先级索引或πgenomic-led目标优先级系统开发。它集成了功能基因组预测,网络连接和免疫本体知识优先考虑潜在药物靶点的基因和通路水平。
作者:海方,ULTRA-DD财团,朱利安·C骑士
维护人员:海方< hfang。上海gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“π”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“π”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“π”)
| HTML | R脚本 | π用户手册(R / Bioconductor包) |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,GeneTarget,遗传学,GenomeWideAssociation,GraphAndNetwork,嗝,LinkageDisequilibrium,网络,通路,软件 |
| 版本 | 测试盒框 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | igraph,dnet,ggplot2、图形 |
| 进口 | 矩阵,GenomicRanges,GenomeInfoDb,supraHex,尺度grDevices,ggrepel,ROCR,randomForest,glmnet,晶格,脱字符号,plot3D、统计数据、方法质量,IRanges,BiocGenerics,dplyr,tidyr,ggnetwork,osfr,RCircos,purrr,readr,宠物猫 |
| 链接 | |
| 建议 | foreach,doParallel,BiocStyle,knitr,rmarkdown,png,GGally,gridExtra,ggforce,fgsea,RColorBrewer,ggpubr,rtracklayer,ggbio,Gviz,data.tree,jsonlite |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://pi314.r-forge.r-project.org |
| BugReports | https://github.com/hfang-bristol/Pi/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Pi_2.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Pi_2.4.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | Pi_2.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Pi |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/π |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Pi/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
