PhosR

DOI:10.18129 / B9.bioc.PhosR

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PhosR

一系列的方法和工具对phosphoproteomics数据的综合分析

Bioconductor版本:3.13

PhosR是一揽子comprenhensive phosphoproteomic数据的分析。PhosR有两个主要组件:下游处理和分析。PhosR由phosphoproteomics数据的各种处理工具包括滤波、归责,正常化和功能分析推断活跃激酶和信号通路。

作者:杨Pengyi (aut) Taiyun金(aut (cre),哈尼族Jieun金(aut)

维修工:Taiyun金< Taiyun。在gmail.com kim91 >

从内部引用(R,回车引用(“PhosR”)):

安装

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PhosR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 蛋白质组学,ResearchField,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(1年)
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R (> = 4.1.0)
进口 ruv,e1071,dendextend,limma,pcaMethods统计数据,RColorBrewer,circlize,dplyr,igraph,pheatmap,preprocessCore,tidyr,rlang、图形grDevices跑龙套,SummarizedExperiment、方法、S4Vectors,BiocGenerics,ggplot2,GGally,ggdendro,ggpubr,网络,reshape2,ggtext
链接
建议 testthat,knitr,rgl,系统网络体系结构(sna),线索,directPA,rmarkdown,org.Rn.eg.db,org.Mm.eg.db,reactome.db,注释,BiocStyle,stringr,校准
SystemRequirements
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包档案

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源包 PhosR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 PhosR_1.2.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) PhosR_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PhosR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PhosR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PhosR/
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