PanVizGenerator

DOI:10.18129 / B9.bioc.PanVizGenerator

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见PanVizGenerator

从你的泛基因组生成PanViz可视化

Bioconductor版本:3.13

PanViz是一个基于JavaScript的泛基因组功能注释可视化工具。PanVizGenerator是PanViz的伙伴,它促进了创建工作PanViz可视化所需的必要数据预处理步骤。输出是完全独立的,因此可视化的接收者不需要安装R或PanVizGenerator。

作者:Thomas Lin Pedersen

维护者:Thomas Lin Pedersen

引文(从R内,输入引用(“PanVizGenerator”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PanVizGenerator”)

超文本标记语言 R脚本 使用PanVizGenerator创建PanViz可视化
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ComparativeGenomicsGUI软件可视化
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(5.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 方法
进口 闪亮的、工具、jsonlitepcaMethodsFindMyFriendsigraph,统计,效用
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthat消化
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator
BugReports https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 PanVizGenerator_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 PanVizGenerator_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) PanVizGenerator_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PanVizGenerator
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PanVizGenerator
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PanVizGenerator/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网