PCAN

DOI:10.18129 / B9.bioc.PCAN

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PCAN。

表现型一致分析(PCAN)

Bioconductor版本:3.13

表型比较基于共识的一种途径。评估候选基因之间的关系和一组基于额外的基因表型相关候选人(例如通路或网络邻居)。

作者:马修·佩奇和帕特里斯·戈达尔

维护人员:马修页面<马太福音。在ucb.com页面>和帕特里斯·戈达尔<帕特里斯。戈达尔在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PCAN”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“PCAN”)

HTML	R脚本	评估一组表型的基因相关性
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,FunctionalPrediction,遗传学,网络,通路,测序,软件,VariantAnnotation
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(5.5年)
许可证	CC BY-NC-ND 4.0
取决于	R (> = 3.3),BiocParallel
进口	grDevices,统计数据
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,reactome.db,STRINGdb
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PCAN_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	PCAN_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	PCAN_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PCAN
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PCAN
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PCAN/
包下载报告	下载数据