过去的

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAST

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅过去的。

通路协会研究工具(过去)

Bioconductor版本:3.13

过去需要GWAS产出和分配snp基因,利用这些基因找到途径与基因相关,根据意义和情节通路。实现的方法阅读GWAS输入数据,寻找相关基因单核苷酸多态性,计算浓缩分数和通路的重要性,和策划通路。

作者:研究亚当(cre, aut], DeOrnellis梅森(aut)

维修工:研究亚当在igbb.msstate.edu <研究>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(过去)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	过去的
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,通路,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	GPL(> = 3) +文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	属性,跑龙套,dplyr,rlang,迭代器平行,foreach,doParallel,qvalue,rtracklayer,ggplot2,GenomicRanges,S4Vectors
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/IGBB/past
BugReports	https://github.com/IGBB/past/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PAST_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	PAST_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	PAST_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAST
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/过去
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PAST/
包下载报告	下载数据