PAIRADISE

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAIRADISE

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见PAIRADISE

配对分析:差异亚型表达的配对分析

Bioconductor版本:3.13

该软件包实现了PAIRADISE程序,用于检测配对RNA-Seq数据中匹配复制之间的差异异构体表达。

作者:Levon Demirdjian,吴颖年,邢毅

维护者:强胡<强。Hu在roswellpark.org>, Levon Demirdjian

引文(从R内,输入引用(“PAIRADISE”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PAIRADISE")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PAIRADISE”)

超文本标记语言 R脚本 PAIRADISE
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews AlternativeSplicingDifferentialExpressionImmunoOncologyRNASeq软件StatisticalMethod
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(2.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.6),nloptr
进口 SummarizedExperimentS4Vectors,统计,方法,abindBiocParallel
链接
建议 testthatknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 PAIRADISE_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 PAIRADISE_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) PAIRADISE_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAIRADISE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PAIRADISE
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PAIRADISE/
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