Organism.dplyr

DOI:10.18129 / B9.bioc.Organism.dplyr

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Organism.dplyr

dplyr-based Bioconductor注释资源的访问

Bioconductor版本:3.13

这个包提供了一种替代方法接口Bioconductor“注释”资源,尤其是基因标识符映射“org”包的功能(例如,org.Hs.eg.db)和基因组的协调功能的TxDb包(例如,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene)。

作者:马丁•摩根(aut (cre)丹尼尔·范Twisk[所有],Yubo程(aut)

维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

从内部引用(R,回车引用(“Organism.dplyr”)):

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Organism.dplyr”)

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文本 新闻

细节

biocViews 注释,GenomeAnnotation,测序,软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.4),dplyr(> = 0.7.0),AnnotationFilter(> = 1.1.3)
进口 RSQLite,S4Vectors,GenomeInfoDb,IRanges,GenomicRanges,GenomicFeatures,AnnotationDbi,rlang、方法、工具,跑龙套,BiocFileCache,DBI,dbplyr,宠物猫
链接
建议 org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,org.Mm.eg.db,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,ggplot2
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取决于我 注释
进口我 Ularcirc
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源包 Organism.dplyr_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 Organism.dplyr_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉) Organism.dplyr_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Organism.dplyr
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Organism.dplyr
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Organism.dplyr/
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