OVESEG

DOI:10.18129 / B9.bioc.OVESEG

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅OVESEG。

OVESEG-test检测组织/特异性标记

Bioconductor版本:3.13

/ R包多集团相比,检测组织特异性标记基因亚型。它提供函数来计算OVESEG-test统计,得出组件混合空分布模型中的权重和加权聚合估计假定值排列。获得后验概率的组件零假设也可以描绘各种各样的upregulation亚型之间的模式。

作者:陈露露< luluchen vt.edu >

维护人员:露露陈< luluchen vt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“OVESEG”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	OVESEG用户手册
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,GeneExpression,MultipleComparison,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6)
进口	统计,跑龙套、方法BiocParallel,SummarizedExperiment,limma,fdrtool,Rcpp
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat,ggplot2,gridExtra、网格reshape2,尺度
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Lululuella/OVESEG
取决于我
进口我
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我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	OVESEG_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	OVESEG_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	OVESEG_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OVESEG
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ OVESEG
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OVESEG/
包下载报告	下载数据