NormalyzerDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.NormalyzerDE

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见NormalyzerDE．

评价归一化方法，计算微分表达式分析统计量

Bioconductor版本:3.13

NormalyzerDE为基于LC-MS的表达数据提供归一化方法筛选。它使用现有方法和新的时间分段方法计算一系列标准化矩阵，计算性能度量并生成评估报告。此外，它为基于Limma或ANOVA的差异表达分析提供了一个简单的实用程序。

作者:Jakob Willforss

维护者:Jakob Willforss < Jakob。Willforss在hotmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NormalyzerDE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“NormalyzerDE”)

PDF	R脚本	差异表达和使用NormalyzerDE对抗技术偏差
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，DifferentialExpression，代谢组学，MultipleComparison，归一化，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)
进口	vsn，preprocessCore，limma，质量，猿，车，ggplot2、方法、Biobase，RcmdrMisc，光栅， utils，统计，SummarizedExperiment，matrixStats，ggforce
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown，roxygen2，hexbin，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ComputationalProteomics/NormalyzerDE
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	NormalyzerDE_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	NormalyzerDE_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	NormalyzerDE_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NormalyzerDE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NormalyzerDE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NormalyzerDE/
软件包下载报告	下载数据