NBSplice

DOI:10.18129 / B9.bioc.NBSplice

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NBSplice

负二项模型检测微分拼接

Bioconductor版本:3.13

方案提出了一种微分拼接基于同种型量化评价方法。应用广义线性模型与负二项分布来推断同种型相对表达的变化。

作者:加芙美利奴和埃尔默a·费尔南德斯

维护人员:加芙美利奴<美利奴。在gmail.com gabriela33 >

从内部引用(R,回车引用(“NBSplice”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NBSplice”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NBSplice”)

HTML R脚本 NBSplice-vignette
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ImmunoOncology,RNASeq,回归,软件,StatisticalMethod
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(3年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(> = 3.5),方法
进口 刨边机统计数据,质量,,mppa,BiocParallel,ggplot2,reshape2
链接
建议 knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.ar
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 NBSplice_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 NBSplice_1.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) NBSplice_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBSplice
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NBSplice
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/NBSplice/
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