MsCoreUtils

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsCoreUtils

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MsCoreUtils。

质谱数据的核心跑龙套

Bioconductor版本:3.13

MsCoreUtils定义了质谱数据和底层函数是独立于任何高级的数据结构。这些功能包括质谱处理功能(噪声估计,平滑、装箱),定量聚合函数(平均波兰,健壮的概括,…),归责丢失的数据,数据正常化(分位数、vsn…)以及misc辅助函数,使用在高级数据结构内部的R质谱分析包。

作者:RforMassSpectrometry包维护者(cre)。劳伦与(aut),Johannes Rainer (aut)Sebastian吉布(aut)Adriaan贴纸(施),Sigurdur Smarason[所有],托马斯Naake[所有]约瑟玛丽亚十二月Aparicio(施),迈克尔情报(施)

维修工:RforMassSpectrometry包维护者<维护者rformassspectrometry.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MsCoreUtils”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MsCoreUtils”)

HTML	R脚本	质谱数据的核心跑龙套
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	方法,S4Vectors,质量统计数据,线索
链接	Rcpp
建议	testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,roxygen2,imputeLCMD,嫁祸于,规范,pcaMethods,vsn,preprocessCore
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils/issues
取决于我
进口我	MsBackendMassbank,MsBackendMgf,MsFeatures,MSnbase,QFeatures,scp,光谱,xcms
建议我	msqrob2
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MsCoreUtils_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	MsCoreUtils_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MsCoreUtils_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsCoreUtils
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsCoreUtils
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsCoreUtils/
包下载报告	下载数据