此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见MsBackendMgf.
Bioconductor版本:3.13
质谱(MS)数据后台支持从Mascot通用格式(mgf)文件导入和导出MS/MS谱数据。这个包中定义的对象应该与Spectra Bioconductor包一起使用。这个包因此增加了mgf文件支持光谱包。
作者:rformassspectra Package Maintainer [cre], Laurent Gatto [aut],约翰·雷纳[au],塞巴斯蒂安·吉布[au]
维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者
引文(从R内,输入引用(“MsBackendMgf”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MsBackendMgf")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MsBackendMgf”)
超文本标记语言 | R脚本 | MsBackendMgf的描述和使用 |
参考手册 |
biocViews | DataImport,基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(< 6个月) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1),光谱(> = 1.0) |
进口 | BiocParallel,S4Vectors,IRanges,MsCoreUtils、方法、统计 |
链接 | |
建议 | testthat,knitr(> = 1.1.0版),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf |
BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | xcms |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MsBackendMgf_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | MsBackendMgf_1.0.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | MsBackendMgf_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMgf |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMgf |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMgf/ |
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