MsBackendMgf

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMgf

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见MsBackendMgf

吉祥物通用格式(mgf)文件的质谱数据后端

Bioconductor版本:3.13

质谱(MS)数据后台支持从Mascot通用格式(mgf)文件导入和导出MS/MS谱数据。这个包中定义的对象应该与Spectra Bioconductor包一起使用。这个包因此增加了mgf文件支持光谱包。

作者:rformassspectra Package Maintainer [cre], Laurent Gatto [aut],约翰·雷纳[au],塞巴斯蒂安·吉布[au]

维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者

引文(从R内,输入引用(“MsBackendMgf”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MsBackendMgf")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendMgf”)

超文本标记语言 R脚本 MsBackendMgf的描述和使用
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport基础设施MassSpectrometry代谢组学蛋白质组学软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(< 6个月)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1),光谱(> = 1.0)
进口 BiocParallelS4VectorsIRangesMsCoreUtils、方法、统计
链接
建议 testthatknitr(> = 1.1.0版),roxygen2BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf
BugReports https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf/issues
全靠我
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建议我 xcms
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MsBackendMgf_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendMgf_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) MsBackendMgf_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMgf
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMgf
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMgf/
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