MsBackendMassbank

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMassbank

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MsBackendMassbank。

质谱数据的后端MassBank记录文件

Bioconductor版本:3.13

质谱(MS)数据后端支持进出口MS / MS库光谱从MassBank记录文件。可以通过不同的后端处理纯MassBank文本文件中数据的格式或允许也直接与MassBank SQL数据库交互。对象从这个包应该用于光谱Bioconductor包。这个包因此增加了光谱MassBank支持包。

作者:RforMassSpectrometry包维护者(cre),迈克尔情报(aut),Johannes Rainer (aut)

维修工:RforMassSpectrometry包维护者<维护者rformassspectrometry.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MsBackendMassbank”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MsBackendMassbank”)

HTML	R脚本	MsBackendMassbank的描述和用法
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0),光谱(> = 1.0)
进口	BiocParallel,S4Vectors,IRanges、方法、ProtGenerics,MsCoreUtils,DBI,跑龙套
链接
建议	testthat,knitr(> = 1.1.0),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),RSQLite,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MsBackendMassbank_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMassbank_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MsBackendMassbank_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMassbank
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MsBackendMassbank
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMassbank/
包下载报告	下载数据