MetaNeighbor

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaNeighbor

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MetaNeighbor。

单细胞复现性分析

Bioconductor版本:3.13

MetaNeighbor允许用户跨数据集使用的邻居投票量化细胞类型可复制性。

作者:梅根乌鸦(aut (cre),萨拉Ballouz[所有],Manthan沙(施),斯蒂芬菲舍尔(施),杰西·吉利斯(aut)

维修工:斯蒂芬费舍尔菲舍尔< cshl.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MetaNeighbor”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MetaNeighbor”)

PDF	R脚本	MetaNeighbor用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	去,GeneExpression,ImmunoOncology,MultipleComparison,SingleCell,软件,转录组
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.5)
进口	grDevices、图形的方法,统计数据(> = 3.4),跑龙套(> = 3.4),矩阵(> = 1.2),matrixStats(> = 0.54),beanplot(> = 1.2),gplots(> = 3.0.1),RColorBrewer(> = 1.1.2),SummarizedExperiment(> = 1.12),SingleCellExperiment,igraph,dplyr,tidyr,宠物猫,ggplot2
链接
建议	knitr(> = 1.17),rmarkdown(> = 1.6),testthat(> = 1.0.2中),UpSetR
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MetaNeighbor_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MetaNeighbor_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MetaNeighbor_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaNeighbor
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MetaNeighbor
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaNeighbor/
包下载报告	下载数据