MSstatsTMT

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsTMT

这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSstatsTMT

蛋白质意义分析猎枪质量spectrometry-based蛋白质组学实验与串联质量标签(TMT)标签

Bioconductor版本:3.13

包提供了统计工具,用于检测不同丰富蛋白质猎枪质量spectrometry-based蛋白质组的串联实验质量标签(TMT)标签。它提供多种功能,包括aata可视化、蛋白质量化和标准化,和统计建模和推理。此外,内部可操作与其他数据处理工具,如蛋白质组发现者,MaxQuant, OpenMS SpectroMine。

作者:Ting黄(aut (cre)之一Meena崔(aut) Mateusz Staniak (aut) Sicheng郝(aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:黄Ting < thuang0703 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“MSstatsTMT”)):

安装

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文本 新闻

细节

biocViews ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本 2.0.1
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.0)
进口 limma,lme4,lmerTest、方法、data.table,统计,跑龙套,ggplot2grDevices图形,MSstats,MSstatsConvert,使彻底失败
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL http://msstats.org/msstatstmt/
BugReports https://groups.google.com/forum/ # ! / msstats论坛
取决于我
进口我 MSstatsPTM,MSstatsTMTPTM
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包档案

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源包 MSstatsTMT_2.0.1.tar.gz
Windows二进制 MSstatsTMT_2.0.1.zip
macOS 10.13(高山脉) MSstatsTMT_2.0.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsTMT
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstatsTMT
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsTMT/
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