这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MACSr。
Bioconductor版本:3.13
ChIP-Seq的基于模型的分析(mac)是一种广泛使用的工具包,用于识别转录因子结合位点。这个包是一个R的最新MACS3的包装器。
作者:羌胡(aut (cre)
维修工:羌胡<羌族。胡在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(“MACSr”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MACSr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MACSr”)
HTML | R脚本 | MACSr |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | ATACSeq,ChIPSeq,ImmunoOncology,软件 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月) |
许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.1.0) |
进口 | 跑龙套,网状,S4Vectors、方法、蛇怪,ExperimentHub,AnnotationHub |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,MACSdata |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | MACSr_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | MACSr_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MACSr |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MACSr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MACSr/ |
包下载报告 | 下载数据 |