花边
DOI:10.18129 / B9.bioc.LACE
此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见花边．
癌症进化的纵向分析(LACE)
Bioconductor版本:3.13
LACE是一种算法框架，它处理来自不同时间点和不同实验环境中收集的癌症样本的单细胞体细胞突变谱，以产生癌症进化的纵向模型。该方法通过最大化多个时间点上计算的加权似然函数，解决了具有系统发育约束的布尔矩阵分解问题。
作者:Daniele Ramazzotti [aut]
，法布里齐奥·安加罗尼[aut]，达维德·马斯佩罗[cre, aut]，亚历克斯·格劳登齐[aut]，卢卡·德·萨诺[ctb]
维护者:Davide Maspero
引文(从R内，输入引用(“花边”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("LACE")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“花边”)
| R脚本 | 花边 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics，SingleCell，软件，SomaticMutation |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(1.5年) |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.0.0) |
| 进口 | data.tree，图形，grDevices，igraph平行,RColorBrewer，Rfast统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocGenerics，BiocStyle，testthat，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/BIMIB-DISCo/LACE |
| BugReports | https://github.com/BIMIB-DISCo/LACE |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | LACE_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | LACE_1.4.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | LACE_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LACE |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LACE |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LACE/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
